Nampula dispõe de 7.817.100 hectares de florestas, contudo segundo o Fundo Nacional de Desenvolvimento Sustentável (FNDS), citado pelo Observatório do Meio Rural (OMR) Nampula teve uma perda de cerca de 10,5% da cobertura florestal, sendo a província com maior desmatamento a nível nacional (entre os anos 1972 e 2016), demandando projectos de reflorestamento com o engajamento do sector privado e comunidades, com impacto a nível local e nacional.
Com vista a preservação das potencialidades económicas das excelentes condições florestais e faunísticos, foram estabelecidas 6 reservas como se descreve abaixo:

• Reserva Florestal de Mecúburi – com 195.000 hectares situada no distrito do mesmo nome. As espécies mais predominantes são Brachysteigia Combretum, Moco, Umbila, Jambirre, Mucorea, Nacuva e Pau-Preto. A reserva florestal de Mecuburi ainda dispõe de excelentes condições naturais para a prática do turismo cinegético e de montanha cuja abrangência se estende aos distritos de Ribáuè e Malema;
• Reserva Florestal de Matibane – com uma área de 6.400 ha, no distrito de Mossuril. A espécie floresta que abunda é o mecrusse. Daí, o facto de a reserva também ser conhecida por mecrussiana;
• Reserva Florestal do Baixo Pinda – com 19.600 ha, no distrito de Memba. As espécies mais comuns são pau-preto, mecrusse e casuarinas;
  Reserva Florestal do Ribáuè – com uma área de 5.200 ha. inclui o monte Ribáuè (1.563m) e algumas espécies hidrófilas que surgem nos vales. A espécie mais predominante é brachystegia cambretum; e
• Reserva Florestal de Mpalué – com uma superfície de 5.100 ha, no distrito de Ribáuè. A brachystegia cambretum é a espécie florestal dominante;
• Reserva Florestal de Maziotela no distrito de Monapo – é uma reserva privada, com 1000 ha, as espécies mais predominantes são tule e Umbaua. Usada com reflorestamento de espécies medicinais.

Nampula é também rica em madeiras preciosas e semi-preciosas, com grande potencial para exploração industrial. As espécies florestais mais exploradas na Província de Nampula são: Jambire, chanfuta, umbila, pau-preto e pau-rosa, com maior predominância nos distritos de Mecubúri, Memba, Muecate, Meconta, Nacarôa, Moma, Mogovolas, Murrupula, Lalaua, Eráti, Angoche, Monapo, Mogincual e Mossuril.

Ainda a província tem áreas de protecção ambiental das Ilhas primeiras e segundas nos Distritos de Angoche, Larde e Moma.