A Província de Nampula tem grande potencial em recursos hídricos, gerados na sua totalidade dentro do país, na sua maioria sub-aproveitados para a promoção do desenvolvimento. Os recursos hídricos são representados essencialmente por rios e lagoas permanentes e periódicos. De uma forma geral, o potencial hídrico favorece a disponibilidade de água para vários fins, sobretudo para o abastecimento a população rural e urbana, a prática da actividade agrícola e industrial, para além da construção de barragens hidroelétricas. Este potencial é constituído por 29 bacias hidrográficas, das quais, as principais são os seguintes:

a) Rio Lúrio – com uma extensão de 61.423.19 Km e uma precipitação anual média de 1.029 mm e um escoamento anual médio de 8.722 hm. No relatório “Avaliação do potencial de desenvolvimento e inventariação dos recursos hidráulicos da bacia do rio Lúrio” elaborado em 1980 pela Hidrotécnica Portuguesa, foram identificados os principais usos potenciais de recursos hídricos, que incluem a produção total de hidro energia podendo atingir 6,000 GWh (mas apenas 50% deste valor pode ser garantido em 95% do tempo) e cerca de 2,000,000 ha foram identificados como tendo potencial para a agricultura, dos quais 500,000 ha poderão ser irrigados em 80% do tempo . O potencial da bacia do rio Lúrio apresenta condições para o abastecimento de água, com volume anual estimado em 189.000.000 m3.

b) Rio Ligonha – com 14.552.72 Km, uma precipitação anual média de 1.134 mm e um escoamento anual médio de 3.740 hm;

c) Rio Melúli – com 9.398.31 Km, uma precipitação anual média de 1.160 mm e um escoamento anual 3médio de 2.406 hm;

d) Rio Monapo – com extensão de 7.734.24 Km, uma precipitação anual média de 1.095 mm e um escoamento anual médio de 975 hm. Sobre o rio foi construída a barragem que abastece água à Cidade de Nampula e outra no distrito de Monapo, essencialmente destinada à irrigação.

e) Rio Mecubúri – com 8.925,34 km, regista uma precipitação anual média de 1.258 mm e um escoamento anual médio de 509 hm.

f) Rio Sanhute – com uma capacidade de abastecimento de água de 40.000m3/dia, para abastecimento da área da bacia de Nacala.

Grande parte das lagoas distribui-se pelos distritos costeiros, particularmente os da região sul da Província, com um grande potencial para aquacultura, irrigação e turismo.